統計元：総務省「独立行政法人の役職員の給与等の水準（平成15～18年度）」
独立行政法人の法人の長の平成18年の平均年収は1885.9万円でした。以下は各独立行政法人の長の報酬リストとなります。
平成18年度 独立行政法人【法人の長】 報酬リスト
所管省庁 |
法人名 |
平均報酬（万円） |
内閣府 |
国立公文書館 |
2031.0 |
内閣府 |
国民生活センター |
1638.2 |
内閣府 |
北方領土問題対策協会 |
1946.6 |
内閣府 |
沖縄科学技術研究基盤整備機構 |
1760.0 |
総務省 |
統計センター |
1886.7 |
総務省 |
情報通信研究機構 |
2312.3 |
総務省 |
平和祈念事業特別基金 |
1720.8 |
法務省 |
日本司法支援センター |
- |
外務省 |
国際協力機構 |
2291.2 |
外務省 |
国際交流基金 |
2016.7 |
財務省 |
造幣局 |
2126.4 |
財務省 |
国立印刷局 |
2094.1 |
財務省 |
酒類総合研究所 |
1460.7 |
財務省 |
通関情報処理センター |
1891.8 |
財務省 |
日本万国博覧会記念機構 |
1902.8 |
文部科学省 |
国立特別支援教育総合研究所 |
1841.9 |
文部科学省 |
大学入試センター |
1855.5 |
文部科学省 |
国立青少年教育振興機構 |
1764.3 |
文部科学省 |
国立女性教育会館 |
1446.1 |
文部科学省 |
国立国語研究所 |
1875.6 |
文部科学省 |
国立美術館 |
2000.0 |
文部科学省 |
国立文化財機構 |
1883.1 |
文部科学省 |
国立博物館 |
2066.9 |
文部科学省 |
教員研修センター |
1824.0 |
文部科学省 |
科学技術振興機構 |
1886.3 |
文部科学省 |
日本学術振興会 |
1921.3 |
文部科学省 |
理化学研究所 |
2008.4 |
文部科学省 |
宇宙航空研究開発機構 |
2294.9 |
文部科学省 |
日本スポーツ振興センター |
1880.6 |
文部科学省 |
日本芸術文化振興会 |
1924.3 |
文部科学省 |
日本学生支援機構 |
1895.5 |
文部科学省 |
物質・材料研究機構 |
1967.8 |
文部科学省 |
防災科学技術研究所 |
1458.7 |
文部科学省 |
放射線医学総合研究所 |
1748.8 |
文部科学省 |
海洋研究開発機構 |
2008.3 |
文部科学省 |
国立高等専門学校機構 |
1850.7 |
文部科学省 |
大学評価・学位授与機構 |
2685.7 |
文部科学省 |
国立大学財務・経営センター |
1776.3 |
文部科学省 |
メディア教育開発センター |
1800.5 |
文部科学省 |
日本原子力研究開発機構 |
2081.8 |
厚生労働省 |
国立健康・栄養研究所 |
1887.1 |
厚生労働省 |
労働安全衛生総合研究所 |
1727.6 |
厚生労働省 |
勤労者退職金共済機構 |
1912.6 |
厚生労働省 |
高齢・障害者雇用支援機構 |
1830.3 |
厚生労働省 |
福祉医療機構 |
1855.2 |
厚生労働省 |
国立重度知的障害者総合施設 |
1394.9 |
厚生労働省 |
労働政策研究・研修機構 |
1724.0 |
厚生労働省 |
雇用・能力開発機構 |
2015.7 |
厚生労働省 |
労働者健康福祉機構 |
1858.0 |
厚生労働省 |
国立病院機構 |
2456.6 |
厚生労働省 |
医薬品医療機器総合機構 |
1722.4 |
厚生労働省 |
医薬基盤研究所 |
1840.2 |
厚生労働省 |
年金・健康保険福祉施設整理機構 |
2197.8 |
厚生労働省 |
年金積立金管理運用独立行政法人 |
2048.5 |
農林水産省 |
農林水産消費技術センター |
1439.3 |
農林水産省 |
種苗管理センター |
1583.3 |
農林水産省 |
家畜改良センター |
1731.3 |
農林水産省 |
水産大学校 |
1681.3 |
農林水産省 |
森林総合研究所 |
1776.5 |
農林水産省 |
農業・食品産業技術総合研究機構 |
1572.5 |
農林水産省 |
農業生物資源研究所 |
1755.1 |
農林水産省 |
農業環境技術研究所 |
1580.1 |
農林水産省 |
国際農林水産業研究センター |
1580.1 |
農林水産省 |
水産総合研究センター |
1733.4 |
農林水産省 |
農畜産業振興機構 |
1785.6 |
農林水産省 |
農業者年金基金 |
1724.1 |
農林水産省 |
農林漁業信用基金 |
2060.2 |
農林水産省 |
緑資源機構 |
1854.5 |
農林水産省 |
肥飼料検査所 |
1420.0 |
農林水産省 |
農薬検査所 |
1396.6 |
農林水産省 |
林木育種センター |
1536.7 |
経済産業省 |
製品評価技術基盤機構 |
1819.9 |
経済産業省 |
経済産業研究所 |
2235.2 |
経済産業省 |
工業所有権情報・研修館 |
1977.3 |
経済産業省 |
日本貿易保険 |
2318.9 |
経済産業省 |
産業技術総合研究所 |
2448.1 |
経済産業省 |
新エネルギー・産業技術総合開発機構 |
2273.8 |
経済産業省 |
日本貿易振興機構 |
2308.3 |
経済産業省 |
原子力安全基盤機構 |
2248.3 |
経済産業省 |
情報処理推進機構 |
2107.1 |
経済産業省 |
石油天然ガス・金属鉱物資源機構 |
2275.6 |
経済産業省 |
中小企業基盤整備機構 |
2255.4 |
国土交通省 |
土木研究所 |
1834.8 |
国土交通省 |
建築研究所 |
1666.8 |
国土交通省 |
交通安全環境研究所 |
1839.6 |
国土交通省 |
海上技術安全研究所 |
1894.3 |
国土交通省 |
港湾空港技術研究所 |
1859.3 |
国土交通省 |
電子航法研究所 |
1865.3 |
国土交通省 |
海技教育機構 |
1505.9 |
国土交通省 |
航海訓練所 |
2031.6 |
国土交通省 |
航空大学校 |
1667.9 |
国土交通省 |
鉄道建設・運輸施設整備支援機構 |
2295.4 |
国土交通省 |
国際観光振興機構 |
1913.0 |
国土交通省 |
水資源機構 |
2033.1 |
国土交通省 |
自動車事故対策機構 |
1924.9 |
国土交通省 |
自動車検査独立行政法人 |
1924.9 |
国土交通省 |
空港周辺整備機構 |
1717.6 |
国土交通省 |
海上災害防止センター |
1726.2 |
国土交通省 |
都市再生機構 |
2238.7 |
国土交通省 |
住宅金融支援機構 |
2201.0 |
国土交通省 |
奄美群島振興開発基金 |
1169.9 |
国土交通省 |
日本高速道路保有・債務返済機構 |
2312.9 |
環境省 |
国立環境研究所 |
1826.2 |
環境省 |
環境再生保全機構 |
2051.7 |
防衛省 |
駐留軍労務者労務管理機構 |
1718.1 |
上記年収は法人の長以外にそれに相当する役職（館長、理事長、総裁）も含まれています。各独立行政法人の法人の長は1人となっています。
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＜統計元＞
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